Pankrease vähk on üks surmavamaid kasvajaid maailmas, mille prognoos on halb.Seetõttu on kõrge kõhunäärmevähi riskiga patsientide tuvastamiseks vaja täpset prognoosimudelit, et kohandada ravi ja parandada nende patsientide prognoosi.
Saime vähi genoomi atlase (TCGA) pankrease adenokartsinoomi (PAAD) RNAseq andmed UCSC Xena andmebaasist, tuvastasime korrelatsioonianalüüsi abil immuunsüsteemiga seotud lncRNA-d (irlncRNA-d) ja tuvastasime erinevused TCGA ja normaalsete pankrease adenokartsinoomi kudede vahel.DEirlncRNA) TCGA-st ja pankrease koe genotüübi koe ekspressioonist (GTEx).Prognoosiliste signatuurimudelite konstrueerimiseks viidi läbi täiendavad ühemõõtmelised ja lasso regressioonianalüüsid.Seejärel arvutasime kõvera aluse pindala ja määrasime optimaalse piirväärtuse kõrge ja madala riskiga pankrease adenokartsinoomiga patsientide tuvastamiseks.Kõrge ja madala riskiga kõhunäärmevähiga patsientide kliiniliste tunnuste, immuunrakkude infiltratsiooni, immunosupressiivse mikrokeskkonna ja keemiaravi resistentsuse võrdlemiseks.
Tuvastasime 20 DEirlncRNA paari ja rühmitasime patsiendid optimaalse piirväärtuse järgi.Näitasime, et meie prognostilisel allkirjamudelil on PAAD-ga patsientide prognoosi ennustamisel märkimisväärne jõudlus.ROC kõvera AUC on 1 aasta prognoosi puhul 0,905, 2 aasta prognoosi puhul 0,942 ja 3 aasta prognoosi puhul 0,966.Kõrge riskiga patsientidel oli madalam elulemus ja halvemad kliinilised omadused.Samuti näitasime, et kõrge riskiga patsiendid on immuunsupresseeritud ja neil võib tekkida resistentsus immunoteraapia suhtes.Vähivastaste ravimite, nagu paklitakseel, sorafeniib ja erlotiniib, hindamine arvutuslike ennustusvahendite põhjal võib olla asjakohane kõrge riskiga PAAD-ga patsientidele.
Üldiselt lõi meie uuring uue prognostilise riskimudeli, mis põhineb paaris irlncRNA-l, mis näitas paljutõotavat prognostilist väärtust kõhunäärmevähiga patsientidel.Meie prognostiline riskimudel võib aidata eristada PAAD-ga patsiente, kes sobivad meditsiiniliseks raviks.
Pankrease vähk on pahaloomuline kasvaja, mille viieaastane elulemus on madal ja kõrge astmega.Diagnoosi ajal on enamik patsiente juba kaugelearenenud staadiumis.COVID-19 epideemia kontekstis on arstid ja õed kõhunäärmevähiga patsientide ravimisel tohutu surve all ning ka patsientide perekonnad seisavad raviotsuste tegemisel silmitsi mitmekordse survega [1, 2].Kuigi DOAD-de ravis on tehtud suuri edusamme, nagu neoadjuvantravi, kirurgiline resektsioon, kiiritusravi, keemiaravi, sihitud molekulaarteraapia ja immuunkontrollpunkti inhibiitorid (ICI), jääb viis aastat pärast diagnoosimist ellu vaid umbes 9% patsientidest [3 ].], 4].Kuna pankrease adenokartsinoomi varased sümptomid on ebatüüpilised, diagnoositakse patsientidel tavaliselt metastaasid kaugelearenenud staadiumis [5].Seetõttu peab konkreetse patsiendi jaoks individuaalne terviklik ravi kaaluma kõigi ravivõimaluste eeliseid ja puudusi, mitte ainult elulemuse pikendamiseks, vaid ka elukvaliteedi parandamiseks [6].Seetõttu on patsiendi prognoosi täpseks hindamiseks vajalik tõhus ennustusmudel [7].Seega saab PAAD-ga patsientide ellujäämise ja elukvaliteedi tasakaalustamiseks valida sobiva ravi.
PAAD-i halb prognoos on peamiselt tingitud resistentsusest keemiaravi ravimite suhtes.Viimastel aastatel on tahkete kasvajate ravis laialdaselt kasutatud immuunsüsteemi kontrollpunkti inhibiitoreid [8].Siiski on ICI kasutamine kõhunäärmevähi korral harva edukas [9].Seetõttu on oluline tuvastada patsiendid, kes võivad ICI-ravist kasu saada.
Pikk mittekodeeriv RNA (lncRNA) on teatud tüüpi mittekodeeriv RNA, mille transkriptid on >200 nukleotiidi.LncRNA-d on laialt levinud ja moodustavad umbes 80% inimese transkriptoomist [10].Suur hulk tööd on näidanud, et lncRNA-põhised prognostilised mudelid võivad tõhusalt ennustada patsiendi prognoosi [11, 12].Näiteks tuvastati 18 autofagiaga seotud lncRNA-d, mis genereerivad rinnavähi prognostilisi allkirju [13].Glioomi prognostiliste tunnuste kindlakstegemiseks on kasutatud kuut teist immuunsüsteemiga seotud lncRNA-d [14].
Pankreasevähi puhul on mõned uuringud loonud lncRNA-põhised signatuurid, et ennustada patsiendi prognoosi.3-lncRNA signatuur määrati pankrease adenokartsinoomi korral, mille ROC kõvera alune pindala (AUC) oli vaid 0,742 ja üldine elulemus (OS) 3 aastat [15].Lisaks erinevad lncRNA ekspressiooniväärtused erinevate genoomide, erinevate andmevormingute ja erinevate patsientide lõikes ning ennustava mudeli jõudlus on ebastabiilne.Seetõttu kasutame immuunsusega seotud lncRNA (irlncRNA) signatuuride genereerimiseks uudset modelleerimisalgoritmi, sidumist ja iteratsiooni, et luua täpsem ja stabiilsem ennustav mudel [8].
Normaliseeritud RNAseq andmed (FPKM) ja kliinilise pankreasevähi TCGA ja genotüübi koeekspressiooni (GTEx) andmed saadi UCSC XENA andmebaasist (https://xenabrowser.net/datapages/).GTF-failid saadi Ensembl andmebaasist (http://asia.ensembl.org) ja neid kasutati lncRNA ekspressiooniprofiilide eraldamiseks RNAseqist.Laadisime immuunsusega seotud geenid alla ImmPorti andmebaasist (//www.immport.org) ja tuvastasime korrelatsioonianalüüsi abil immuunsusega seotud lncRNA-d (irlncRNA-d) (p <0,001, r>0,4).Diferentsiaalselt ekspresseeritud irlncRNA-de (DEirlncRNA-de) identifitseerimine GEPIA2 andmebaasist (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) saadud irlncRNA-de ja erinevalt ekspresseeritud lncRNA-de ristamise teel TCGA-PAAD kohordis (|logFC| > 1 ja FDR ) <0,05).
Seda meetodit on varem kirjeldatud [8].Täpsemalt, me konstrueerime X, et asendada paaris lncRNA A ja lncRNA B. Kui lncRNA A ekspressiooniväärtus on kõrgem kui lncRNA B ekspressiooniväärtus, on X defineeritud kui 1, vastasel juhul on X defineeritud kui 0. Seetõttu saame maatriks 0 või – 1. Maatriksi vertikaaltelg tähistab iga proovi ja horisontaaltelg tähistab iga DEirlncRNA paari väärtusega 0 või 1.
Prognostiliste DEirlncRNA paaride skriinimiseks kasutati ühemõõtmelist regressioonianalüüsi, millele järgnes Lasso regressioon.Lasso regressioonianalüüsis kasutati 10-kordset ristvalideerimist, mida korrati 1000 korda (p < 0,05), 1000 juhusliku stiimuliga jooksu kohta.Kui iga DEirlncRNA paari sagedus ületas 1000 tsükli jooksul 100 korda, valiti prognostilise riskimudeli koostamiseks DEirlncRNA paarid.Seejärel kasutasime AUC kõverat, et leida optimaalne piirväärtus PAAD-i patsientide klassifitseerimiseks kõrge ja madala riskiga rühmadesse.Samuti arvutati välja iga mudeli AUC väärtus ja joonistati see kõverana.Kui kõver jõuab kõrgeima punktini, mis näitab maksimaalset AUC väärtust, siis arvutusprotsess peatub ja mudelit peetakse parimaks kandidaadiks.Konstrueeriti 1-, 3- ja 5-aastased ROC-kõvera mudelid.Prognostilise riskimudeli sõltumatu ennustava toimivuse uurimiseks kasutati ühe- ja mitmemõõtmelisi regressioonianalüüse.
Immuunrakkude infiltratsiooni määra uurimiseks kasutage seitset tööriista, sealhulgas XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS ja CIBERSORT.Immuunrakkude infiltratsiooni andmed laaditi alla andmebaasist TIMER2 (//timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3).Konstrueeritud mudeli kõrge ja madala riskiga rühmade immuunsüsteemi infiltreeruvate rakkude sisalduse erinevust analüüsiti Wilcoxoni signed-rank testi abil, tulemused on toodud ruutgraafikul.Spearmani korrelatsioonianalüüs viidi läbi, et analüüsida riskiskoori väärtuste ja immuunsüsteemi infiltreeruvate rakkude vahelist seost.Saadud korrelatsioonikordaja on näidatud pulgakommi kujul.Olulisuse lävi määrati p < 0,05.Protseduur viidi läbi R-paketi ggplot2 abil.Immuunrakkude infiltratsioonikiirusega seotud mudeli ja geeniekspressioonitasemete vahelise seose uurimiseks viisime läbi ggstatsplot paketi ja viiuli graafiku visualiseerimise.
Pankreasevähi kliiniliste ravimustrite hindamiseks arvutasime TCGA-PAAD kohordis tavaliselt kasutatavate keemiaravi ravimite IC50.Poolinhibeerivate kontsentratsioonide (IC50) erinevusi kõrge ja madala riskiga rühmade vahel võrreldi Wilcoxon signed-rank testiga ja tulemused on näidatud kastdiagrammidena, mis on genereeritud kasutades R-s pRRophetic ja ggplot2. Kõik meetodid vastavad asjakohastele juhistele ja normidele.
Meie uuringu töövoog on näidatud joonisel 1. Kasutades lncRNA-de ja immuunsusega seotud geenide vahelist korrelatsioonianalüüsi, valisime välja 724 irlncRNA-d, mille p < 0,01 ja r > 0,4.Järgmisena analüüsisime GEPIA2 erinevalt ekspresseeritud lncRNA-sid (joonis 2A).Pankrease adenokartsinoomi ja normaalse pankrease koe vahel ekspresseeriti diferentseeritult 223 irlncRNA-d (|logFC|> 1, FDR <0,05), mida nimetati DEirlncRNA-deks.
Ennustavate riskimudelite konstrueerimine.(A) Erinevalt ekspresseeritud lncRNA-de vulkaanigraafik.(B) Lasso koefitsientide jaotus 20 DEirlncRNA paari jaoks.(C) LASSO koefitsiendi jaotuse osaline tõenäosus dispersioon.(D) Metsadiagramm, mis näitab 20 DEirlncRNA paari ühemõõtmelist regressioonianalüüsi.
Järgmisena konstrueerisime 0 või 1 maatriksi, sidudes 223 DEirlncRNA-d.Kokku tuvastati 13 687 DEirlncRNA paari.Pärast ühemõõtmelist ja lasso regressioonianalüüsi testiti lõpuks 20 DEirlncRNA paari, et koostada prognostiline riskimudel (joonis 2B-D).Lasso ja mitme regressioonianalüüsi tulemuste põhjal arvutasime TCGA-PAAD kohordi iga patsiendi jaoks riskiskoori (tabel 1).Lasso regressioonianalüüsi tulemuste põhjal arvutasime iga patsiendi jaoks riskiskoori TCGA-PAAD kohordis.ROC kõvera AUC oli 0,905 1-aastase riskimudeli prognoosi korral, 0,942 2-aastase prognoosi korral ja 0,966 3-aastase prognoosi korral (joonis 3A-B).Seadsime optimaalseks piirväärtuseks 3, 105, kihistasime TCGA-PAAD kohordi patsiendid kõrge ja madala riskiga rühmadesse ning joonistasime iga patsiendi ellujäämise tulemused ja riskiskoori jaotused (joonis 3C-E).Kaplan-Meieri analüüs näitas, et PAAD patsientide elulemus kõrge riskiga rühmas oli oluliselt madalam kui madala riskiga rühma patsientide elulemus (p < 0,001) (joonis 3F).
Prognostiliste riskimudelite kehtivus.(A) prognostilise riskimudeli ROC.(B) 1-, 2- ja 3-aastased ROC-i prognostilised riskimudelid.(C) prognostilise riskimudeli ROC.Näitab optimaalset lõikepunkti.(DE) Elulemusseisundi (D) ja riskiskooride (E) jaotus.(F) PAAD-i patsientide Kaplan-Meieri analüüs kõrge ja madala riskiga rühmades.
Lisaks hindasime kliiniliste tunnuste järgi riskiskooride erinevusi.Ribagraafik (joonis 4A) näitab üldist seost kliiniliste tunnuste ja riskiskooride vahel.Eelkõige olid vanematel patsientidel kõrgemad riskiskoorid (joonis 4B).Lisaks oli II staadiumiga patsientidel kõrgem riskiskoor kui I staadiumiga patsientidel (joonis 4C).Seoses kasvaja astmega PAAD patsientidel oli 3. astme patsientidel kõrgem riskiskoor kui 1. ja 2. astme patsientidel (joonis 4D).Lisaks teostasime ühe- ja mitmemõõtmelisi regressioonianalüüse ja näitasime, et riskiskoor (p < 0,001) ja vanus (p = 0,045) olid PAAD-ga patsientidel sõltumatud prognostilised tegurid (joonis 5A–B).ROC kõver näitas, et riskiskoor oli PAAD-ga patsientide 1-, 2- ja 3-aastase elulemuse prognoosimisel teistest kliinilistest tunnustest parem (joonis 5C-E).
Prognostiliste riskimudelite kliinilised omadused.Histogramm (A) näitab (B) vanust, (C) kasvaja staadiumit, (D) kasvaja astet, riskiskoori ja TCGA-PAAD kohorti patsientide sugu.**p < 0,01
Prognostiliste riskimudelite sõltumatu ennustav analüüs.(AB) Ühemõõtmelised (A) ja mitmemõõtmelised (B) prognostiliste riskimudelite ja kliiniliste tunnuste regressioonianalüüsid.(CE) 1-, 2- ja 3-aastane ROC prognostiliste riskimudelite ja kliiniliste tunnuste jaoks
Seetõttu uurisime aja ja riskiskooride vahelist seost.Leidsime, et PAAD-i patsientide riskiskoor oli pöördvõrdelises korrelatsioonis CD8+ T-rakkude ja NK-rakkudega (joonis 6A), mis näitab kõrge riskiga rühmas pärsitud immuunfunktsiooni.Samuti hindasime immuunrakkude infiltratsiooni erinevust kõrge ja madala riskiga rühmade vahel ja leidsime samad tulemused (joonis 7).Kõrge riskiga rühmas esines vähem CD8+ T-rakkude ja NK-rakkude infiltratsiooni.Viimastel aastatel on tahkete kasvajate ravis laialdaselt kasutatud immuunkontrollpunkti inhibiitoreid (ICI).ICI-de kasutamine kõhunäärmevähi korral on aga harva olnud edukas.Seetõttu hindasime immuunsüsteemi kontrollpunkti geenide ekspressiooni kõrge ja madala riskiga rühmades.Leidsime, et CTLA-4 ja CD161 (KLRB1) olid madala riskiga rühmas üleekspresseeritud (joonis 6B-G), mis näitab, et madala riskiga rühma PAAD-i patsiendid võivad olla ICI suhtes tundlikud.
Prognostilise riskimudeli ja immuunrakkude infiltratsiooni korrelatsioonianalüüs.(A) Korrelatsioon prognostilise riskimudeli ja immuunrakkude infiltratsiooni vahel.(BG) Näitab geeniekspressiooni kõrge ja madala riskiga rühmades.(HK) spetsiifiliste vähivastaste ravimite IC50 väärtused kõrge ja madala riskiga rühmades.*p < 0,05, **p < 0,01, ns = mitteoluline
Lisaks hindasime seost riskiskooride ja tavaliste keemiaravi ainete vahel TCGA-PAAD kohordis.Otsisime kõhunäärmevähi puhul sagedamini kasutatavaid vähivastaseid ravimeid ja analüüsisime nende IC50 väärtuste erinevusi kõrge ja madala riskiga rühmade vahel.Tulemused näitasid, et AZD.2281 (olapariibi) IC50 väärtus oli kõrgem kõrge riskiga rühmas, mis näitab, et kõrge riskiga rühmas olevad PAAD-i patsiendid võivad olla AZD.2281-ravi suhtes resistentsed (joonis 6H).Lisaks olid kõrge riskiga rühmas paklitakseeli, sorafeniibi ja erlotiniibi IC50 väärtused madalamad (joonis 6I-K).Lisaks tuvastasime 34 vähivastast ravimit kõrgema IC50 väärtusega kõrge riskiga rühmas ja 34 vähivastast ravimit madalama IC50 väärtusega kõrge riskiga rühmas (tabel 2).
Ei saa eitada, et lncRNA-d, mRNA-d ja miRNA-d eksisteerivad laialdaselt ja neil on vähi arengus ülioluline roll.On palju tõendeid, mis toetavad mRNA või miRNA olulist rolli üldise elulemuse ennustamisel mitme vähitüübi korral.Kahtlemata põhinevad paljud prognostilised riskimudelid ka lncRNA-del.Näiteks Luo et al.Uuringud on näidanud, et LINC01094 mängib võtmerolli PC proliferatsioonis ja metastaasides ning LINC01094 kõrge ekspressioon näitab pankreasevähiga patsientide kehva ellujäämist [16].Lin et al.Uuringud on näidanud, et lncRNA FLVCR1-AS1 allareguleerimine on seotud kõhunäärmevähiga patsientide halva prognoosiga [17].Immuunsusega seotud lncRNA-sid käsitletakse vähihaigete üldise elulemuse ennustamise osas siiski suhteliselt vähem.Viimasel ajal on suur hulk tööd keskendunud prognostiliste riskimudelite loomisele, et ennustada vähihaigete ellujäämist ja seeläbi kohandada ravimeetodeid [18, 19, 20].Üha enam tunnistatakse immuuninfiltraatide olulist rolli vähi tekkes, progresseerumises ja ravivastustes nagu keemiaravi.Paljud uuringud on kinnitanud, et kasvajasse infiltreeruvad immuunrakud mängivad tsütotoksilise keemiaravi vastuses olulist rolli [21, 22, 23].Kasvaja immuunne mikrokeskkond on kasvajaga patsientide ellujäämise oluline tegur [24, 25].Immunoteraapiat, eriti ICI-ravi, kasutatakse laialdaselt tahkete kasvajate ravis [26].Immuunsüsteemiga seotud geene kasutatakse laialdaselt prognostiliste riskimudelite koostamiseks.Näiteks Su et al.Immuunsüsteemiga seotud prognostiline riskimudel põhineb valke kodeerivatel geenidel, et ennustada munasarjavähiga patsientide prognoosi [27].Mittekodeerivad geenid, nagu lncRNA-d, sobivad ka prognostiliste riskimudelite koostamiseks [28, 29, 30].Luo jt testisid nelja immuunsüsteemiga seotud lncRNA-d ja koostasid emakakaelavähi riski ennustava mudeli [31].Khan et al.Kokku tuvastati 32 erinevalt ekspresseeritud transkripti ja selle põhjal koostati 5 olulise ärakirjaga ennustusmudel, mis pakuti väga soovitatavaks vahendiks biopsiaga tõestatud ägeda äratõukereaktsiooni ennustamiseks pärast neerusiirdamist [32].
Enamik neist mudelitest põhinevad geeniekspressioonitasemetel, kas valku kodeerivatel geenidel või mittekodeerivatel geenidel.Samas võib samal geenil olla erinevates genoomides, andmevormingutes ja erinevatel patsientidel erinevad ekspressiooniväärtused, mis põhjustab prognoosimudelites ebastabiilseid hinnanguid.Selles uuringus koostasime kahe lncRNA paariga mõistliku mudeli, mis ei sõltu täpsetest ekspressiooniväärtustest.
Selles uuringus tuvastasime immuunsusega seotud geenidega korrelatsioonianalüüsi kaudu esimest korda irlncRNA.Sõelusime 223 DEirlncRNA-d hübridisatsiooni teel diferentsiaalselt ekspresseeritud lncRNA-dega.Teiseks koostasime avaldatud DEirlncRNA sidumismeetodi [31] põhjal 0- või 1-maatriksi.Seejärel teostasime ühemõõtmelisi ja lasso regressioonianalüüse, et tuvastada prognostilised DEirlncRNA paarid ja konstrueerida ennustav riskimudel.Lisaks analüüsisime PAAD-ga patsientide riskiskooride ja kliiniliste tunnuste vahelist seost.Leidsime, et meie prognostiline riskimudel kui PAAD-i patsientide sõltumatu prognostiline tegur, suudab tõhusalt eristada kõrge astme patsiente madala raskusastmega patsientidest ja kõrge kvaliteediga patsiente madala astme patsientidest.Lisaks olid prognostilise riskimudeli ROC kõvera AUC väärtused 1 aasta prognoosi puhul 0,905, 2 aasta prognoosi puhul 0,942 ja 3 aasta prognoosi puhul 0,966.
Teadlased teatasid, et suurema CD8+ T-rakkude infiltratsiooniga patsiendid olid ICI-ravi suhtes tundlikumad [33].Tsütotoksiliste rakkude, CD56 NK-rakkude, NK-rakkude ja CD8+ T-rakkude sisalduse suurenemine kasvaja immuunmikrokeskkonnas võib olla kasvaja supresseeriva toime üheks põhjuseks [34].Varasemad uuringud näitasid, et kasvajasse infiltreeruva CD4(+) T ja CD8(+) T kõrgem tase oli märkimisväärselt seotud pikema elulemusega [35].Kehv CD8 T-rakkude infiltratsioon, madal neoantigeenikoormus ja väga immunosupressiivne kasvaja mikrokeskkond põhjustavad vastuse puudumise ICI-ravile [36].Leidsime, et riskiskoor oli negatiivses korrelatsioonis CD8+ T-rakkude ja NK-rakkudega, mis näitab, et kõrge riskiskooriga patsiendid ei pruugi ICI-raviks sobida ja neil on halvem prognoos.
CD161 on looduslike tapjarakkude (NK) marker.CD8+CD161+ CAR-transdutseeritud T-rakud vahendavad suurenenud in vivo kasvajavastast efektiivsust HER2+ pankrease duktaalse adenokartsinoomi ksenotransplantaadi mudelites [37].Immuunsuse kontrollpunkti inhibiitorid on suunatud tsütotoksilise T-lümfotsüütidega seotud valgu 4 (CTLA-4) ja programmeeritud rakusurma valgu 1 (PD-1) / programmeeritud rakusurma ligandi 1 (PD-L1) radadele ning neil on paljudes valdkondades suur potentsiaal.CTLA-4 ja CD161 (KLRB1) ekspressioon on kõrge riskiga rühmades madalam, mis näitab veelgi, et kõrge riskiga patsiendid ei pruugi ICI-ravi jaoks sobida.[38]
Kõrge riskiga patsientidele sobivate ravivõimaluste leidmiseks analüüsisime erinevaid vähivastaseid ravimeid ning leidsime, et PAAD-ga patsientidele laialdaselt kasutatavad paklitakseel, sorafeniib ja erlotiniib võivad sobida kõrge riskiga PAAD-ga patsientidele.[33].Zhang jt leidsid, et mis tahes DNA kahjustuse vastuse (DDR) raja mutatsioonid võivad eesnäärmevähiga patsientidel põhjustada halva prognoosi [39].Pancreatic Cancer Olaparib Ongoing (POLO) uuring näitas, et säilitusravi olapariibiga pikendas pärast esmavaliku plaatinapõhist keemiaravi progresseerumisvaba elulemust võrreldes platseeboga patsientidel, kellel oli pankrease ductal adenokartsinoom ja idutee BRCA1/2 mutatsioonid [40].See annab märkimisväärse optimismi, et ravitulemused paranevad märkimisväärselt selles patsientide alarühmas.Selles uuringus oli AZD.2281 (olapariibi) IC50 väärtus kõrge riskiga rühmas, mis näitab, et kõrge riskiga rühma PAAD-ga patsiendid võivad olla AZD.2281-ravi suhtes resistentsed.
Selle uuringu prognoosimudelid annavad häid prognoositulemusi, kuid need põhinevad analüütilistel prognoosidel.Oluline küsimus on, kuidas neid tulemusi kliiniliste andmetega kinnitada.Endoskoopiline peennõelaspiratsiooni ultraheli (EUS-FNA) on muutunud asendamatuks meetodiks tahkete ja pankreaseväliste pankrease kahjustuste diagnoosimisel, mille tundlikkus on 85% ja spetsiifilisus 98% [41].EUS-i peennõelaga biopsia (EUS-FNB) nõelte tulek põhineb peamiselt FNA ees tajutavatel eelistel, nagu suurem diagnostiline täpsus, histoloogilist struktuuri säilitavate proovide saamine ja seega teatud diagnooside jaoks kriitilise tähtsusega immuunkoe tekitamine.spetsiaalne värvimine [42].Kirjanduse süstemaatiline ülevaade kinnitas, et FNB nõelad (eriti 22G) näitavad kõige tõhusamat koe kogumist pankrease massist [43].Kliiniliselt sobib radikaalseks kirurgiaks vaid väike arv patsiente ja enamikul patsientidest on esialgse diagnoosimise ajal operatsioonivõimetud kasvajad.Kliinilises praktikas sobib radikaalseks operatsiooniks vaid väike osa patsientidest, kuna enamikul patsientidest on esmase diagnoosimise ajal operatsioonivõimetud kasvajad.Pärast patoloogilist kinnitust EUS-FNB ja muude meetoditega valitakse tavaliselt standardiseeritud mittekirurgiline ravi, näiteks keemiaravi.Meie järgnev uurimisprogramm on selle uuringu prognostilise mudeli testimine kirurgilistes ja mittekirurgilistes kohortides retrospektiivse analüüsi kaudu.
Üldiselt lõi meie uuring uue prognostilise riskimudeli, mis põhineb paaris irlncRNA-l, mis näitas paljutõotavat prognostilist väärtust kõhunäärmevähiga patsientidel.Meie prognostiline riskimudel võib aidata eristada PAAD-ga patsiente, kes sobivad meditsiiniliseks raviks.
Käesolevas uuringus kasutatud ja analüüsitud andmekogumid on mõistliku taotluse korral kättesaadavad vastavalt autorilt.
Sui Wen, Gong X, Zhuang Y. Enesetõhususe vahendav roll negatiivsete emotsioonide emotsionaalses reguleerimises COVID-19 pandeemia ajal: läbilõikeuuring.Int J Ment Health Nurs [ajakirjaartikkel].2021 01.06.2021;30(3):759–71.
Sui Wen, Gong X, Qiao X, Zhang L, Cheng J, Dong J jt.Pereliikmete seisukohad alternatiivsete otsuste tegemise kohta intensiivraviosakondades: süstemaatiline ülevaade.INT J NURS STUD [ajakirjaartikkel;arvustus].2023 01/01/2023;137:104391.
Vincent A, Herman J, Schulich R, Hruban RH, Goggins M. Pankrease vähk.Lancet.[Ajakirja artikkel;teadusuuringute tugi, NIH, ekstramaalne;teadusuuringute toetamine, valitsus väljaspool USA-d;arvustus].2011 13.08.2011;378(9791):607–20.
Ilic M, Ilic I. Pankreasevähi epidemioloogia.World Journal of Gastroenterology.[Ajakirjaartikkel, ülevaade].2016 28.11.2016;22(44):9694–705.
Liu X, Chen B, Chen J, Sun S. Uus tp53-ga seotud nomogramm kõhunäärmevähiga patsientide üldise elulemuse ennustamiseks.BMC Cancer [ajakirjaartikkel].2021, 31.03.2021;21(1):335.
Xian X, Zhu X, Chen Y, Huang B, Xiang W. Lahusele keskendunud ravi mõju vähiga seotud väsimusele keemiaravi saavatel kolorektaalse vähiga patsientidel: randomiseeritud kontrollitud uuring.Vähiõde.[Ajakirja artikkel;randomiseeritud kontrollitud uuring;uuringut toetab valitsus väljaspool Ameerika Ühendriike].2022 05.01.2022;45(3):E663–73.
Zhang Cheng, Zheng Wen, Lu Y, Shan L, Xu Dong, Pan Y jt.Operatsioonijärgne kartsinoembrüonaalse antigeeni (CEA) tase ennustab normaalse preoperatiivse CEA tasemega patsientidel pärast kolorektaalse vähi resektsiooni tulemust.Translatiivse vähiuuringute keskus.[Ajakirja artikkel].2020 01.01.2020;9(1):111–8.
Hong Wen, Liang Li, Gu Yu, Qi Zi, Qiu Hua, Yang X jt.Immuunsüsteemiga seotud lncRNA-d genereerivad uudseid allkirju ja ennustavad inimese hepatotsellulaarse kartsinoomi immuunmaastikku.Mol Ther Nucleic acids [Ajakirjaartikkel].2020 2020-12-04;22:937 – 47.
Toffey RJ, Zhu Y., Schulich RD Kõhunäärmevähi immunoteraapia: tõkked ja läbimurded.Ann Gastrointestinal Surgeon [ajakirja artikkel;arvustus].2018 01.07.2018;2(4):274–81.
Hull R, Mbita Z, Dlamini Z. Pikad mittekodeerivad RNA-d (LncRNA-d), viiruse kasvaja genoomika ja ebanormaalsed splaissimise sündmused: terapeutilised tagajärjed.AM J CANCER RES [ajakirjaartikkel;arvustus].2021 20.01.2021;11(3):866–83.
Wang J, Chen P, Zhang Y, Ding J, Yang Y, Li H. 11- Endomeetriumi vähi prognoosiga seotud lncRNA signatuuride tuvastamine.Teaduse saavutused [ajakirjaartikkel].2021 2021-01-01;104(1):311977089.
Jiang S, Ren H, Liu S, Lu Z, Xu A, Qin S jt.RNA-d siduva valgu prognostiliste geenide ja ravimikandidaatide põhjalik analüüs papillaarrakulise neerurakulise kartsinoomi korral.pregen.[Ajakirja artikkel].2021 20.01.2021;12:627508.
Li X, Chen J, Yu Q, Huang X, Liu Z, Wang X jt.Autofagiaga seotud pika mittekodeeriva RNA omadused ennustavad rinnavähi prognoosi.pregen.[Ajakirja artikkel].2021 20.01.2021;12:569318.
Zhou M, Zhang Z, Zhao X, Bao S, Cheng L, Sun J. Immuuniga seotud kuue lncRNA signatuur parandab multiformse glioblastoomi prognoosi.MOL neurobioloogia.[Ajakirja artikkel].2018 01.05.2018;55(5):3684–97.
Wu B, Wang Q, Fei J, Bao Y, Wang X, Song Z jt.Uudne tri-lncRNA signatuur ennustab kõhunäärmevähiga patsientide ellujäämist.ONKOLI ESINDAJAD.[Ajakirja artikkel].2018 12/01/2018;40(6):3427–37.
Luo C, Lin K, Hu C, Zhu X, Zhu J, Zhu Z. LINC01094 soodustab kõhunäärmevähi progresseerumist, reguleerides LIN28B ekspressiooni ja PI3K/AKT rada läbi käsnaga miR-577.Mol Therapeutics – nukleiinhapped.2021;26:523–35.
Lin J, Zhai X, Zou S, Xu Z, Zhang J, Jiang L jt.Positiivne tagasiside lncRNA FLVCR1-AS1 ja KLF10 vahel võib pärssida pankreasevähi progresseerumist PTEN/AKT raja kaudu.J EXP Clin Cancer Res.2021;40(1).
Zhou X, Liu X, Zeng X, Wu D, Liu L. Kolmeteistkümne geeni tuvastamine, mis ennustavad üldist ellujäämist hepatotsellulaarse kartsinoomi korral.Biosci Rep [ajakiri].2021 09.04.2021.
Postitusaeg: 22. september 2023