Pankreasevähk on üks surmavamaid kasvajaid maailmas ja selle prognoos on halb. Seetõttu on vaja täpset ennustusmudelit, et tuvastada pankreasevähi kõrge riskiga patsiendid, kohandada ravi ja parandada nende patsientide prognoosi.
Saime UCSC Xena andmebaasist vähi genoomi atlase (TCGA) pankrease adenokartsinoomi (PAAD) RNA järjestuse andmed, tuvastasime korrelatsioonanalüüsi abil immuunsüsteemiga seotud pikad mitte-kodeerivad RNA-d (irlncRNA-d) ja tuvastasime erinevused TCGA ja normaalsete pankrease adenokartsinoomi kudede vahel. DEirlncRNA) TCGA-st ja pankrease koe genotüübi ekspressioon (GTEx). Prognoosiliste signatuurmudelite konstrueerimiseks viidi läbi täiendavad ühemuutuja ja lasso regressioonanalüüsid. Seejärel arvutasime kõvera aluse pindala ja määrasime optimaalse piirväärtuse kõrge ja madala riskiga pankrease adenokartsinoomiga patsientide tuvastamiseks. Kliiniliste tunnuste, immuunrakkude infiltratsiooni, immunosupressiivse mikrokeskkonna ja keemiaravi resistentsuse võrdlemine kõrge ja madala riskiga pankreasevähiga patsientidel.
Me tuvastasime 20 DEirlncRNA paari ja grupeerisime patsiendid optimaalse piirväärtuse järgi. Me näitasime, et meie prognostiline signatuurmudel omab olulist jõudlust PAAD-iga patsientide prognoosi ennustamisel. ROC-kõvera AUC on 1-aastase prognoosi puhul 0,905, 2-aastase prognoosi puhul 0,942 ja 3-aastase prognoosi puhul 0,966. Kõrge riskiga patsientidel oli madalam elulemus ja halvemad kliinilised tunnused. Samuti näitasime, et kõrge riskiga patsientidel on immunosupressioon ja neil võib tekkida resistentsus immunoteraapia suhtes. Vähivastaste ravimite, näiteks paklitakseeli, sorafeniibi ja erlotiniibi hindamine arvutuslike ennustusvahendite abil võib olla sobiv PAAD-iga kõrge riskiga patsientide jaoks.
Kokkuvõttes loodi meie uuringus uus prognostiline riskimudel, mis põhineb paaris-IRLNCRNA-l ja millel oli paljulubav prognostiline väärtus kõhunäärmevähiga patsientidel. Meie prognostiline riskimudel võib aidata eristada PAAD-iga patsiente, kes sobivad raviks.
Pankreasevähk on pahaloomuline kasvaja, millel on madal viieaastane elulemus ja kõrge astme häire. Diagnoosimise ajal on enamik patsiente juba kaugelearenenud staadiumis. COVID-19 epideemia kontekstis on arstid ja õed pankreasevähiga patsientide ravimisel tohutu surve all ning patsientide perekonnad seisavad samuti raviotsuste tegemisel silmitsi mitmekordse survega [1, 2]. Kuigi DOAD-ide ravis on tehtud suuri edusamme, näiteks neoadjuvantravi, kirurgiline resektsioon, kiiritusravi, keemiaravi, sihipärane molekulaarne ravi ja immuunkontrollpunkti inhibiitorid (ICI-d), elab viis aastat pärast diagnoosi vaid umbes 9% patsientidest [3]. ], 4]. Kuna pankrease adenokartsinoomi varajased sümptomid on ebatüüpilised, diagnoositakse patsientidel metastaasid tavaliselt kaugelearenenud staadiumis [5]. Seetõttu peab antud patsiendi puhul individuaalne terviklik ravi kaaluma kõigi ravivõimaluste eeliseid ja puudusi, mitte ainult elulemuse pikendamiseks, vaid ka elukvaliteedi parandamiseks [6]. Seetõttu on patsiendi prognoosi täpseks hindamiseks vajalik tõhus ennustusmudel [7]. Seega saab valida sobiva ravi, et tasakaalustada PAAD-iga patsientide elulemust ja elukvaliteeti.
PAAD-i halb prognoos on peamiselt tingitud resistentsusest keemiaravi ravimite suhtes. Viimastel aastatel on immuunkontrollpunkti inhibiitoreid laialdaselt kasutatud tahkete kasvajate ravis [8]. ICI-de kasutamine kõhunäärmevähi korral on aga harva edukas [9]. Seetõttu on oluline tuvastada patsiendid, kellele ICI-ravi võiks kasu olla.
Pikk mittekodeeriv RNA (lncRNA) on mittekodeeriva RNA tüüp, mille transkriptid on >200 nukleotiidi pikad. LncRNA-d on laialt levinud ja moodustavad umbes 80% inimese transkriptoomist [10]. Suur hulk uuringuid on näidanud, et lncRNA-põhised prognostilised mudelid suudavad tõhusalt ennustada patsiendi prognoosi [11, 12]. Näiteks identifitseeriti 18 autofaagiaga seotud lncRNA-d, mis genereerivad rinnavähi prognostilisi signatuure [13]. Gliooma prognostiliste tunnuste kindlakstegemiseks on kasutatud kuut muud immuunsüsteemiga seotud lncRNA-d [14].
Pankreasevähi puhul on mõned uuringud loonud lncRNA-põhised signatuurid patsientide prognoosi ennustamiseks. Pankrease adenokartsinoomi puhul loodi 3-lncRNA signatuur, mille ROC-kõvera alune pindala (AUC) oli vaid 0,742 ja üldine elulemus (OS) 3 aastat [15]. Lisaks varieeruvad lncRNA ekspressiooniväärtused erinevate genoomide, erinevate andmevormingute ja erinevate patsientide vahel ning ennustusmudeli toimivus on ebastabiilne. Seetõttu kasutame uudset modelleerimisalgoritmi, sidumist ja iteratsiooni, et genereerida immuunsusega seotud lncRNA (irlncRNA) signatuure täpsema ja stabiilsema ennustusmudeli loomiseks [8].
Normaliseeritud RNAseq andmed (FPKM) ja kliinilise pankreasevähi TCGA ja genotüübi koeekspressiooni (GTEx) andmed saadi UCSC XENA andmebaasist (https://xenabrowser.net/datapages/). GTF-failid saadi Ensembli andmebaasist (http://asia.ensembl.org) ja neid kasutati RNAseq-ist lncRNA ekspressiooniprofiilide ekstraheerimiseks. Laadisime immuunsusega seotud geenid alla ImmPort andmebaasist (http://www.immport.org) ja tuvastasime immuunsusega seotud lncRNA-d (irlncRNA-d) korrelatsioonianalüüsi abil (p < 0,001, r > 0,4). Diferentsiaalselt ekspresseeritud irlncRNA-de (DEirlncRNA-de) identifitseerimine irlncRNA-de ja diferentsiaalselt ekspresseeritud lncRNA-de ristamise teel, mis saadi GEPIA2 andmebaasist (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) TCGA-PAAD kohordis (|logFC| > 1 ja FDR) <0,05).
Sellest meetodist on varem juttu olnud [8]. Täpsemalt konstrueerime X, et asendada paaris lncRNA A ja lncRNA B. Kui lncRNA A ekspressiooniväärtus on suurem kui lncRNA B ekspressiooniväärtus, on X defineeritud kui 1, vastasel juhul on X defineeritud kui 0. Seega saame maatriksi väärtusega 0 või –1. Maatriksi vertikaaltelg tähistab iga valimit ja horisontaaltelg tähistab iga DEirlncRNA paari väärtusega 0 või 1.
Prognostiliste DEirlncRNA paaride skriinimiseks kasutati ühemõõtmelist regressioonanalüüsi, millele järgnes lasso regressioon. Lasso regressioonanalüüsis kasutati 10-kordset ristvalideerimist, mida korrati 1000 korda (p < 0,05), 1000 juhusliku stiimuliga tsükli kohta. Kui iga DEirlncRNA paari sagedus ületas 100 korda 1000 tsükli jooksul, valiti DEirlncRNA paarid prognostilise riskimudeli konstrueerimiseks. Seejärel kasutasime AUC-kõverat optimaalse piirväärtuse leidmiseks PAAD-patsientide liigitamiseks kõrge ja madala riskiga rühmadesse. Iga mudeli AUC väärtus arvutati ja joonistati kõverana. Kui kõver jõuab kõrgeima punktini, mis näitab maksimaalset AUC-väärtust, peatatakse arvutusprotsess ja mudelit peetakse parimaks kandidaadiks. Konstrueeriti 1-, 3- ja 5-aastased ROC-kõvera mudelid. Prognostilise riskimudeli sõltumatu ennustava toimivuse uurimiseks kasutati ühemõõtmelist ja mitmemõõtmelist regressioonanalüüsi.
Immuunrakkude infiltratsiooni määrade uurimiseks kasutati seitset tööriista, sealhulgas XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS ja CIBERSORT. Immuunrakkude infiltratsiooni andmed laaditi alla TIMER2 andmebaasist (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3). Konstrueeritud mudeli kõrge ja madala riskiga rühmade immuunsüsteemi infiltreeruvate rakkude sisalduse erinevust analüüsiti Wilcoxoni astakmärgitesti abil, tulemused on näidatud ruutgraafikul. Riskiskoori väärtuste ja immuunsüsteemi infiltreeruvate rakkude vahelise seose analüüsimiseks viidi läbi Spearmani korrelatsioonianalüüs. Saadud korrelatsioonikordaja on näidatud pulgakommi kujul. Olulisuse lävi seati väärtusele p < 0,05. Protseduur viidi läbi R-paketi ggplot2 abil. Mudeli ja immuunrakkude infiltratsiooni määraga seotud geeniekspressiooni tasemete vahelise seose uurimiseks kasutasime ggstatsplot paketti ja Violin Plot visualiseerimist.
Pankreasevähi kliiniliste ravimustrite hindamiseks arvutasime TCGA-PAAD kohordis tavaliselt kasutatavate keemiaravi ravimite IC50. Kõrge ja madala riskiga rühmade vahelisi poolinhibeerivate kontsentratsioonide (IC50) erinevusi võrreldi Wilcoxoni astakmärgitesti abil ning tulemused on esitatud pRRophetic ja ggplot2 abil R-is genereeritud kastidiagrammidena. Kõik meetodid vastavad asjakohastele suunistele ja normidele.
Meie uuringu töövoog on näidatud joonisel 1. Kasutades lncRNA-de ja immuunsusega seotud geenide vahelist korrelatsioonianalüüsi, valisime 724 irlncRNA-d, mille p < 0,01 ja r > 0,4. Seejärel analüüsisime GEPIA2 diferentsiaalselt ekspresseeritud lncRNA-sid (joonis 2A). Kokku 223 irlncRNA-d ekspresseeriti diferentsiaalselt pankrease adenokartsinoomi ja normaalse pankreasekoe vahel (|logFC| > 1, FDR < 0,05), mida nimetati DEirlncRNA-deks.
Ennustavate riskimudelite konstrueerimine. (A) Diferentsiaalselt ekspresseeritud lncRNA-de vulkaanidiagramm. (B) 20 DEirlncRNA paari lassokordajate jaotus. (C) LASSO koefitsiendi jaotuse osaline tõenäosusdispersioon. (D) Metsadiagramm, mis näitab 20 DEirlncRNA paari ühemõõtmelist regressioonanalüüsi.
Järgmisena konstrueerisime 0 või 1 maatriksi, paaristades 223 DEirlncRNA-d. Kokku identifitseeriti 13 687 DEirlncRNA paari. Pärast ühemuutuja ja lasso regressioonanalüüsi testiti lõpuks 20 DEirlncRNA paari prognostilise riskimudeli konstrueerimiseks (joonis 2B-D). Lasso ja mitmekordse regressioonanalüüsi tulemuste põhjal arvutasime iga TCGA-PAAD kohordi patsiendi riskiskoori (tabel 1). Lasso regressioonanalüüsi tulemuste põhjal arvutasime iga TCGA-PAAD kohordi patsiendi riskiskoori. ROC-kõvera AUC oli 1-aastase riskimudeli prognoosi puhul 0,905, 2-aastase prognoosi puhul 0,942 ja 3-aastase prognoosi puhul 0,966 (joonis 3A-B). Me määrasime optimaalseks piirväärtuseks 3,105, jagasime TCGA-PAAD kohordi patsiendid kõrge ja madala riskiga rühmadesse ning joonistasime graafikule iga patsiendi elulemuse tulemused ja riskiskoori jaotused (joonis 3C-E). Kaplan-Meieri analüüs näitas, et PAAD-patsientide elulemus kõrge riskiga rühmas oli oluliselt madalam kui madala riskiga rühma patsientidel (p < 0,001) (joonis 3F).
Prognostiliste riskimudelite kehtivus. (A) Prognostilise riskimudeli ROC. (B) 1-, 2- ja 3-aastased ROC prognostilised riskimudelid. (C) Prognostilise riskimudeli ROC. Näitab optimaalset piirväärtust. (DE) Ellujäämisstaatuse (D) ja riskiskooride (E) jaotus. (F) PAAD-patsientide Kaplan-Meieri analüüs kõrge ja madala riskiga rühmades.
Lisaks hindasime riskiskooride erinevusi kliiniliste tunnuste lõikes. Ribadiagramm (joonis 4A) näitab üldist seost kliiniliste tunnuste ja riskiskooride vahel. Eelkõige olid vanematel patsientidel kõrgemad riskiskoorid (joonis 4B). Lisaks olid II staadiumi patsientidel kõrgemad riskiskoorid kui I staadiumi patsientidel (joonis 4C). PAAD-i patsientide kasvaja astme osas olid 3. astme patsientidel kõrgemad riskiskoorid kui 1. ja 2. astme patsientidel (joonis 4D). Lisaks viisime läbi ühe- ja mitmemõõtmelisi regressioonanalüüse ning näitasime, et riskiskoor (p < 0,001) ja vanus (p = 0,045) olid PAAD-iga patsientidel sõltumatud prognostilised tegurid (joonis 5A-B). ROC-kõver näitas, et riskiskoor oli PAAD-i patsientide 1-, 2- ja 3-aastase elulemuse ennustamisel teistest kliinilistest tunnustest parem (joonis 5C-E).
Prognostiliste riskimudelite kliinilised omadused. Histogramm (A) näitab TCGA-PAAD kohordi patsientide (B) vanust, (C) kasvaja staadiumi, (D) kasvaja astet, riskiskoori ja sugu. **p < 0,01
Prognostiliste riskimudelite sõltumatu ennustav analüüs. (AB) Prognostiliste riskimudelite ja kliiniliste tunnuste ühemuutujaline (A) ja mitmemuutujaline (B) regressioonanalüüs. (CE) Prognostiliste riskimudelite ja kliiniliste tunnuste 1-, 2- ja 3-aastane ROC.
Seetõttu uurisime aja ja riskiskoori vahelist seost. Leidsime, et PAAD-i patsientide riskiskoor oli pöördvõrdelises korrelatsioonis CD8+ T-rakkude ja NK-rakkudega (joonis 6A), mis viitab pärsitud immuunfunktsioonile kõrge riskiga rühmas. Samuti hindasime immuunrakkude infiltratsiooni erinevust kõrge ja madala riskiga rühmade vahel ning leidsime samad tulemused (joonis 7). Kõrge riskiga rühmas oli CD8+ T-rakkude ja NK-rakkude infiltratsioon väiksem. Viimastel aastatel on immuunkontrollpunkti inhibiitoreid (ICI-sid) laialdaselt kasutatud tahkete kasvajate ravis. ICI-de kasutamine kõhunäärmevähi korral on aga harva olnud edukas. Seetõttu hindasime immuunkontrollpunkti geenide ekspressiooni kõrge ja madala riskiga rühmades. Leidsime, et CTLA-4 ja CD161 (KLRB1) olid madala riskiga rühmas üleekspresseeritud (joonis 6B-G), mis näitab, et madala riskiga rühma PAAD-i patsiendid võivad olla ICI suhtes tundlikud.
Prognostilise riskimudeli ja immuunrakkude infiltratsiooni korrelatsioonianalüüs. (A) Prognostilise riskimudeli ja immuunrakkude infiltratsiooni vaheline korrelatsioon. (BG) Näitab geeniekspressiooni kõrge ja madala riskiga rühmades. (HK) Spetsiifiliste vähivastaste ravimite IC50 väärtused kõrge ja madala riskiga rühmades. *p < 0,05, **p < 0,01, ns = ebaoluline
Lisaks hindasime TCGA-PAAD kohordis riskiskoori ja tavaliste keemiaravimite vahelist seost. Otsisime kõhunäärmevähi ravis sageli kasutatavaid vähivastaseid ravimeid ja analüüsisime nende IC50 väärtuste erinevusi kõrge ja madala riskiga rühmade vahel. Tulemused näitasid, et AZD.2281 (olapariib) IC50 väärtus oli kõrge riskiga rühmas kõrgem, mis näitab, et kõrge riskiga rühma PAAD-patsiendid võivad olla AZD.2281 ravi suhtes resistentsed (joonis 6H). Lisaks olid paklitakseeli, sorafeniibi ja erlotiniibi IC50 väärtused kõrge riskiga rühmas madalamad (joonis 6I-K). Lisaks tuvastasime 34 vähivastast ravimit, millel olid kõrge riskiga rühmas kõrgemad IC50 väärtused, ja 34 vähivastast ravimit, millel olid kõrge riskiga rühmas madalamad IC50 väärtused (tabel 2).
Ei saa eitada, et pikad mittekoodavad RNA-d, mRNA-d ja miRNA-d eksisteerivad laialdaselt ja mängivad vähi tekkes olulist rolli. On palju tõendeid, mis toetavad mRNA või miRNA olulist rolli üldise elulemuse ennustamisel mitut tüüpi vähi korral. Kahtlemata põhinevad paljud prognostilised riskimudelid samuti lncRNA-del. Näiteks Luo jt uuringud on näidanud, et LINC01094 mängib võtmerolli PC proliferatsioonis ja metastaasides ning LINC01094 kõrge ekspressioon näitab kõhunäärmevähiga patsientide kehva elulemust [16]. Lin jt esitatud uuring on näidanud, et lncRNA FLVCR1-AS1 allareguleerimine on seotud kõhunäärmevähiga patsientide halva prognoosiga [17]. Immuunsusega seotud lncRNA-sid käsitletakse aga vähihaigete üldise elulemuse ennustamise seisukohast suhteliselt vähem. Hiljuti on suur osa tööst keskendunud prognostiliste riskimudelite loomisele, et ennustada vähihaigete elulemust ja seeläbi kohandada ravimeetodeid [18, 19, 20]. Üha enam tunnistatakse immuuninfiltraatide olulist rolli vähi algatamises, progresseerumises ja ravivastuses sellistele ravimeetoditele nagu keemiaravi. Arvukad uuringud on kinnitanud, et kasvajasse infiltreeruvatel immuunrakkudel on tsütotoksilisele keemiaravile reageerimisel kriitiline roll [21, 22, 23]. Kasvaja immuunmikrokeskkond on oluline tegur kasvajaga patsientide ellujäämisel [24, 25]. Immunoteraapiat, eriti ICI-ravi, kasutatakse laialdaselt tahkete kasvajate ravis [26]. Immuunsüsteemiga seotud geene kasutatakse laialdaselt prognostiliste riskimudelite loomiseks. Näiteks Su jt. Immuunsüsteemiga seotud prognostiline riskimudel põhineb valke kodeerivatel geenidel, et ennustada munasarjavähiga patsientide prognoosi [27]. Mittekodeerivad geenid, näiteks pikad mittekodeerivad RNA-d (lncRNA-d), sobivad samuti prognostiliste riskimudelite loomiseks [28, 29, 30]. Luo jt. testisid nelja immuunsüsteemiga seotud pikad mittekodeerivad RNA-d ja ehitasid emakakaelavähi riski ennustava mudeli [31]. Khan jt. Kokku identifitseeriti 32 diferentseeritult ekspresseeritud transkripti ja selle põhjal loodi 5 olulise transkriptiga ennustusmudel, mida pakuti välja kui väga soovitatavat vahendit biopsiaga tõestatud ägeda äratõukereaktsiooni ennustamiseks pärast neerusiirdamist [32].
Enamik neist mudelitest põhineb geenide ekspressioonitasemetel, olgu need siis valku kodeerivad või mittekodeerivad geenid. Samas võivad samal geenil olla erinevates genoomides, andmevormingutes ja erinevatel patsientidel erinevad ekspressiooniväärtused, mis viib ennustusmudelites ebastabiilsete hinnanguteni. Selles uuringus ehitasime mõistliku mudeli kahe lncRNA paariga, mis ei sõltu täpsetest ekspressiooniväärtustest.
Selles uuringus tuvastasime esmakordselt irlncRNA immuunsusega seotud geenidega korrelatsioonanalüüsi abil. Skriiniti 223 DEirlncRNA-d diferentsiaalselt ekspresseeritud lncRNA-dega hübridiseerimise teel. Teiseks konstrueerisime avaldatud DEirlncRNA sidumismeetodi [31] põhjal 0-või-1 maatriksi. Seejärel viisime läbi ühemuutuja ja lasso regressioonanalüüse, et tuvastada prognostilisi DEirlncRNA paare ja konstrueerida ennustav riskimudel. Analüüsisime edasi seost riskiskooride ja kliiniliste tunnuste vahel PAAD-iga patsientidel. Leidsime, et meie prognostiline riskimudel kui PAAD-i patsientide sõltumatu prognostiline tegur suudab tõhusalt eristada kõrge astme patsiente madala astme patsientidest ja kõrge astme patsiente madala astme patsientidest. Lisaks olid prognostilise riskimudeli ROC-kõvera AUC väärtused 1-aastase prognoosi puhul 0,905, 2-aastase prognoosi puhul 0,942 ja 3-aastase prognoosi puhul 0,966.
Teadlased teatasid, et suurema CD8+ T-rakkude infiltratsiooniga patsiendid olid ICI-ravi suhtes tundlikumad [33]. Tsütotoksiliste rakkude, CD56 NK-rakkude, NK-rakkude ja CD8+ T-rakkude sisalduse suurenemine kasvaja immuunmikrokeskkonnas võib olla üks kasvajat pärssiva toime põhjusi [34]. Varasemad uuringud näitasid, et kasvajasse infiltreeruvate CD4(+) T- ja CD8(+) T-rakkude kõrgem tase oli oluliselt seotud pikema elulemusega [35]. Halb CD8 T-rakkude infiltratsioon, madal neoantigeeni hulk ja tugevalt immunosupressiivne kasvaja mikrokeskkond viisid ICI-ravile reageerimise puudumiseni [36]. Leidsime, et riskiskoor oli negatiivses korrelatsioonis CD8+ T-rakkude ja NK-rakkudega, mis näitab, et kõrge riskiskooriga patsiendid ei pruugi ICI-raviks sobida ja neil on halvem prognoos.
CD161 on looduslike tapjarakkude (NK-rakkude) marker. CD8+CD161+ CAR-transdutseeritud T-rakud vahendavad HER2+ pankrease duktaalse adenokartsinoomi ksenotransplantaadimudelites suurenenud in vivo kasvajavastast efektiivsust [37]. Immuunsüsteemi kontrollpunkti inhibiitorid on suunatud tsütotoksiliste T-lümfotsüütidega seotud valgu 4 (CTLA-4) ja programmeeritud rakusurma valgu 1 (PD-1) / programmeeritud rakusurma ligandi 1 (PD-L1) radadele ning neil on suur potentsiaal paljudes valdkondades. CTLA-4 ja CD161 (KLRB1) ekspressioon on kõrge riskiga rühmades madalam, mis näitab veelgi, et kõrge riskiga patsiendid ei pruugi ICI-raviks sobida. [38]
Kõrge riskiga patsientidele sobivate ravivõimaluste leidmiseks analüüsisime erinevaid vähivastaseid ravimeid ja leidsime, et paklitakseel, sorafeniib ja erlotiniib, mida PAAD-iga patsientidel laialdaselt kasutatakse, võivad sobida ka kõrge riskiga PAAD-i patsientidele. [33]. Zhang jt leidsid, et mis tahes DNA kahjustuse vastuse (DDR) raja mutatsioonid võivad eesnäärmevähiga patsientidel põhjustada halba prognoosi [39]. Pancreatic Cancer Olaparib Ongoing (POLO) uuring näitas, et säilitusravi olapariibiga pikendas progresseerumisvaba elulemust võrreldes platseeboga pärast esmavaliku plaatinapõhist keemiaravi pankrease duktaalse adenokartsinoomi ja iduliini BRCA1/2 mutatsioonidega patsientidel [40]. See annab märkimisväärset optimismi, et ravitulemused paranevad selles patsientide alarühmas oluliselt. Selles uuringus oli AZD.2281 (olapariib) IC50 väärtus kõrge riskiga rühmas kõrgem, mis näitab, et kõrge riskiga rühma PAAD-i patsiendid võivad olla AZD.2281-ravi suhtes resistentsed.
Käesolevas uuringus kasutatud prognoosimudelid annavad häid ennustustulemusi, kuid need põhinevad analüütilistel prognoosidel. Oluline küsimus on, kuidas neid tulemusi kliiniliste andmetega kinnitada. Endoskoopiline peennõela aspiratsioonultraheliograafia (EUS-FNA) on muutunud asendamatuks meetodiks pankrease tahkete ja ekstrapankreaatiliste kahjustuste diagnoosimisel, mille tundlikkus on 85% ja spetsiifilisus 98% [41]. EUS-i peennõelbiopsia (EUS-FNB) nõelte tulek põhineb peamiselt tajutavatel eelistel FNA ees, nagu suurem diagnostiline täpsus, histoloogilise struktuuri säilitavate proovide saamine ja seega immuunkoe genereerimine, mis on teatud diagnooside puhul kriitilise tähtsusega. Spetsiifiline värvimine [42]. Kirjanduse süstemaatiline ülevaade kinnitas, et FNB nõelad (eriti 22G) näitavad pankrease massidest kudede kogumisel suurimat efektiivsust [43]. Kliiniliselt on radikaalseks operatsiooniks kõlblikud vaid väike arv patsiente ja enamikul patsientidest on esmase diagnoosi ajal opereerimatud kasvajad. Kliinilises praktikas sobib radikaalseks operatsiooniks vaid väike osa patsientidest, kuna enamikul patsientidest on esmase diagnoosi ajal opereerimatud kasvajad. Pärast patoloogilise diagnoosi kinnitamist EUS-FNB ja teiste meetoditega valitakse tavaliselt standardiseeritud mittekirurgiline ravi, näiteks keemiaravi. Meie järgnev uurimisprogramm on testida selle uuringu prognostilist mudelit kirurgilistes ja mittekirurgilistes kohortides retrospektiivse analüüsi abil.
Kokkuvõttes loodi meie uuringus uus prognostiline riskimudel, mis põhineb paaris-IRLNCRNA-l ja millel oli paljulubav prognostiline väärtus kõhunäärmevähiga patsientidel. Meie prognostiline riskimudel võib aidata eristada PAAD-iga patsiente, kes sobivad raviks.
Käesolevas uuringus kasutatud ja analüüsitud andmekogumid on vastavalt autorilt mõistliku taotluse korral kättesaadavad.
Sui Wen, Gong X, Zhuang Y. Enesetõhususe vahendaja roll negatiivsete emotsioonide emotsionaalses regulatsioonis COVID-19 pandeemia ajal: läbilõikeuuring. Int J Ment Health Nurs [ajakirjaartikkel]. 2021 06.01.2021;30(3):759–71.
Sui Wen, Gong X, Qiao X, Zhang L, Cheng J, Dong J jt. Pereliikmete seisukohad alternatiivsete otsustusmeetodite kohta intensiivravi osakondades: süstemaatiline ülevaade. INT J NURS STUD [ajakirjaartikkel; ülevaade]. 2023 01.01.2023;137:104391.
Vincent A, Herman J, Schulich R, Hruban RH, Goggins M. Pankreasevähk. Lancet. [Ajakirjaartikkel; uurimistoetus, NIH, väljastpoolt USA-d; uurimistoetus, valitsus väljaspool USA-d; ülevaade]. 2011 13.08.2011;378(9791):607–20.
Ilic M, Ilic I. Pankreasevähi epidemioloogia. World Journal of Gastroenterology. [Ajakirjaartikkel, ülevaade]. 28.11.2016;22(44):9694–705.
Liu X, Chen B, Chen J, Sun S. Uus tp53-ga seotud nomogramm kõhunäärmevähiga patsientide üldise elulemuse ennustamiseks. BMC Cancer [ajakirjaartikkel]. 2021 31-03-2021;21(1):335.
Xian X, Zhu X, Chen Y, Huang B, Xiang W. Lahenduskeskse ravi mõju vähiga seotud väsimusele kolorektaalvähiga patsientidel, kes saavad keemiaravi: randomiseeritud kontrollitud uuring. Vähiõde. [Ajakirjaartikkel; randomiseeritud kontrollitud uuring; uuringut toetab valitsus väljaspool Ameerika Ühendriike]. 2022 05/01/2022;45(3):E663–73.
Zhang Cheng, Zheng Wen, Lu Y, Shan L, Xu Dong, Pan Y jt. Postoperatiivne kartsinoembrüoonse antigeeni (CEA) tase ennustab kolorektaalse vähi resektsiooni tulemust patsientidel, kellel on preoperatiivne CEA tase normaalne. Center for Translational Cancer Research. [Ajakirjaartikkel]. 2020 01.01.2020;9(1):111–8.
Hong Wen, Liang Li, Gu Yu, Qi Zi, Qiu Hua, Yang X jt. Immuunsüsteemiga seotud pikad mittekodeerivad RNA-d (lncRNA-d) genereerivad uusi signaale ja ennustavad inimese hepatotsellulaarse kartsinoomi immuunmaastikku. Mol Ther Nucleic acids [Ajakirjaartikkel]. 2020 2020-12-04;22:937 – 47.
Toffey RJ, Zhu Y., Schulich RD. Kõhunäärmevähi immunoteraapia: takistused ja läbimurded. Ann Gastrointestinal Surgeon [Ajakirjaartikkel; ülevaade]. 2018 01.07.2018;2(4):274–81.
Hull R, Mbita Z, Dlamini Z. Pikad mittekodeerivad RNA-d (LncRNA-d), viiruskasvaja genoomika ja aberrantsed splaissingu sündmused: terapeutilised implikatsioonid. AM J CANCER RES [ajakirjaartikkel; ülevaade]. 2021 20.01.2021;11(3):866–83.
Wang J, Chen P, Zhang Y, Ding J, Yang Y, Li H. 11 - Endomeetriumi vähi prognoosiga seotud lncRNA signatuuride tuvastamine. Teaduse saavutused [ajakirjaartikkel]. 2021 2021-01-01;104(1):311977089.
Jiang S, Ren H, Liu S, Lu Z, Xu A, Qin S jt. RNA-siduvate valkude prognostiliste geenide ja ravimikandidaatide põhjalik analüüs papillaarse neerurakulise kartsinoomi korral. pregen. [Ajakirjaartikkel]. 20.01.2021;12:627508.
Li X, Chen J, Yu Q, Huang X, Liu Z, Wang X jt. Autofaagiaga seotud pika mittekodeeriva RNA omadused ennustavad rinnavähi prognoosi. pregen. [Ajakirjaartikkel]. 20.01.2021;12:569318.
Zhou M, Zhang Z, Zhao X, Bao S, Cheng L, Sun J. Immuunsüsteemiga seotud kuue pika koe-RNA signatuur parandab glioblastoomi multiforme prognoosi. MOL Neurobiology. [Ajakirjaartikkel]. 2018 01.05.2018;55(5):3684–97.
Wu B, Wang Q, Fei J, Bao Y, Wang X, Song Z jt. Uudne tri-lncRNA signatuur ennustab pankreasevähiga patsientide elulemust. ONKOLI ESINDAJAD. [Ajakirjaartikkel]. 2018 12.01.2018;40(6):3427–37.
Luo C, Lin K, Hu C, Zhu X, Zhu J, Zhu Z. LINC01094 soodustab kõhunäärmevähi progresseerumist, reguleerides LIN28B ekspressiooni ja PI3K/AKT rada läbi käsnaga kaetud miR-577. Mol Therapeutics – Nucleic acids. 2021;26:523–35.
Lin J, Zhai X, Zou S, Xu Z, Zhang J, Jiang L jt. Positiivne tagasiside lncRNA FLVCR1-AS1 ja KLF10 vahel võib pärssida pankreasevähi progresseerumist PTEN/AKT raja kaudu. J EXP Clin Cancer Res. 2021;40(1).
Zhou X, Liu X, Zeng X, Wu D, Liu L. Kolmeteistkümne geeni identifitseerimine, mis ennustavad hepatotsellulaarse kartsinoomi üldist elulemust. Biosci Rep [ajakirjaartikkel]. 2021 09.04.2021.
Postituse aeg: 22. september 2023